21 августа 1943 года Новосибирск выделен в самостоятельный административно-хозяйственный центр и отнесен к категории городов республиканского подчинения.
К категории городов республиканского подчинения могли быть отнесены населенные пункты, являющиеся экономическими и культурными центрами, имеющие развитую промышленность, с численностью населения свыше 50 тысяч человек. Особый статус, в том числе бюджетный, объясняется их исключительным административно-политическим, экономическим или военно-стратегическим значением.
Новосибирск в годы войны стал одним из крупнейших центров сосредоточения оборонной промышленности на востоке страны. Это являлось одним из оснований, чтобы выделить его в самостоятельный административный центр и отнести к категории городов республиканского подчинения.
3 июня 1958 года, в ходе хрущевской реформы управления, город вновь переведен в областное подчинение. В 1958 году из 15 городов в прежнем статусе оставили только два – Москву и Ленинград. В постсоветское время категория «город республиканского подчинения» заменена категорией «город федерального значения».